- Katedra Archeologii Egejskiej i Włókiennictwa
- Zakład Antropologii Historycznej i Archeologii Wybrzeży Pacyfiku
- Zakład Archeologii Bliskiego Wschodu
- Zakład Archeologii Egiptu i Nubii
- Zakład Archeologii Europy Starożytnej
- Zakład Archeologii Klasycznej
- Zakład Archeologii Podwodnej
- Zakład Archeologii Późnego Średniowiecza i Czasów Nowożytnych
- Zakład Archeologii Pradziejowej
- Zakład Archeologii Prowincji Rzymskich
- Zakład Archeologii Wczesnego Średniowiecza
- Zakład Badań Nieinwazyjnych
- Zakład Bioarcheologii
- Zakład Historii Kultury Materialnej Antyku
- Zakład Kontaktów Świata Śródziemnomorskiego z Barbaricum
- Zakład Paleolitu i Mezolitu
- Zakład Tradycji Antyku w Sztukach Wizualnych